Les auteurs d'une étude majeure sur le pigeon rose autrefois en voie de disparition disent que stimuler les chiffres de l'espèce ne suffit pas pour le sauver de l'extinction à l'avenir.
Malgré l'augmentation de la population, l'analyse de l'équipe montre que le pigeon rose a une charge génétique élevée de mauvaises mutations, ce qui le présente à risque considérable d'extinction dans la nature dans les 100 ans sans actions de conservation continue.
Une collaboration internationale dirigée par des scientifiques de l'Université d'East Anglia (UEA), du Durrell Institute ofConserveation and Ecology (DICE) de l'Université de Kent et de l'Institut Earlham au Royaume-Uni, travaillant avec des organisations sur le terrain à Maurice, a étudié la génétiqueImpacts d'un «goulot d'étranglement» de la population - Un effondrement rapide en nombre qui a affecté le pigeon rose de Maurice à la fin des années 1980, avec seulement 12 oiseaux survivant dans la nature.
The team analysed the DNA of 175 birds sampled over nearly 20 years as subsequent conservation efforts took place.
With the help of biologists from the Mauritian Wildlife Foundation and the Durrell WildlifeConserveation Trust, and in partnership with the Government of Mauritius’ National Parks andConserveation Service, the free-living population of the species has increased to around 500 birds.
Consequently, the pink pigeon has been down-listed twice on the International Union forConserveation of Nature Red List from critically endangered to vulnerable.
However, to keep these populations viable, the researchers warn that ‘genetic rescue’ is needed to recover lost genetic variation caused by inbreeding and to reduce the effects of the harmful mutations.Cela peut être réalisé en libérant des oiseaux en captivité des zoos britanniques et européens.
The study, published inConserveationBiology, used conservation genetic work at DICE, cutting-edge genomic techniques developed at UEA and the Earlham Institute, and computer modelling to closely examine the species’ DNA and assess the risk of future extinction, as well as forecasting what needs to be done to secure the pink pigeon’s viability.Les auteurs disent que leurs conclusions pourraient aider d'autres espèces menacées.
“By studying the genome of a recovered species that was once critically endangered, we can learn how to help other species to bounce back from a population collapse,” said UEA’s Prof Cock van Oosterhout, one of the lead authors.
“During the pigeon’s population bottleneck, the gene pool lost a lot of variation, and many bad mutations increased in frequency.Cette charge génétique représente toujours une menace grave, même si la population s'est rétablie en nombre.”
Prof van Oosterhout, of the School of Environmental Sciences at UEA, added: “The problem is that all individuals are somehow related to each other.Ce sont les descendants des quelques ancêtres qui ont réussi à survivre au goulot d'étranglement.Par conséquent, il devient pratiquement impossible d'arrêter la consanguinité, et cela expose ces mauvaises mutations.
In turn, this can increase the mortality rate, and it could cause the population to collapse again.”
Prof Jim Groombridge, from the University of Kent, explained how the initial recovery of the pink pigeon population was achieved: “A captive population of pink pigeons in the Gerald Durrell Endemic Wildlife Sanctuary in Mauritius, jointly managed by the Mauritian Wildlife Foundation and the National Parks andConserveation Service, was established in the 1970s.
“This was used to breed birds for release into the wild, which boosted population numbers.L'équipe a également restauré l'habitat en contrôlant les espèces introduites et a fourni de la nourriture supplémentaire dans le cadre d'un programme sur le terrain de gestion intensive de la conservation, ce qui a encore augmenté la population de vie libre.”
The study used sophisticated software called SLiM that can model an entire bird chromosome, including all its bad mutations.Les chercheurs ont simulé le goulot d'étranglement et la récupération de la population, puis ils ont comparé les résultats prévus de différents programmes de réintroduction.L'étude a donc pu prédire la viabilité de la population à l'avenir dans différents scénarios de gestion de la conservation.
“We didn’t know how many bad mutations the population carried initially, before the bottleneck,” said Dr Hernan Morales from University of Copenhagen, in Denmark, who performed the SLiM modelling.«Nous avons d'abord dû simuler la population ancestrale pour savoir combien de mauvaises mutations auraient pu évoluer.Nous avons ensuite vérifié ces données avec des données sur les données de dépression de consanguinité des populations de zoo du pigeon rose.”
Using pedigree and fitness data held at Jersey Zoo for over 1000 birds, the team estimated the genetic load, which showed that the pink pigeon carried a high genetic load of 15 lethal equivalents.Cela a ensuite été utilisé pour calibrer les modèles d'ordinateur.
“The computer simulations clearly show that just boosting numbers isn’t enough,” added Dr Morales.«La population a également besoin de« sauvetage génétique »d'oiseaux plus diversifiés génétiquement élevés dans les zoos européens.Ces oiseaux ne sont pas aussi étroitement liés, et ils peuvent aider à réduire le niveau de consanguinité.Cependant, il existe un risque que nous puissions introduire d'autres mauvaises mutations de la population du zoo dans la nature.”
Dr Camilla Ryan, who worked on the project at the Earlham Institute and UEA, said: “Our bioinformatics analysis indicated the importance of genetic diversity and the unique genetic rescue model to help other species from the brink of extinction.Cette recherche met en évidence la valeur des collaborations entre les ONG, les instituts et les universités qui rassemblent une gamme d'expertise.Cela garantit qu'une approche holistique est adoptée à une conservation des espèces qui comprend une compréhension de sa santé génétique.”
Sam Speak, a PhD student at UEA and co-author of the paper, added: “We are now analysing the genome of the pink pigeon from zoo populations here in the UK, trying to locate these bad mutations.Nous pouvons le faire maintenant en utilisant des outils de bioinformatique développés pour étudier la génétique humaine et les génomes d'autres espèces d'oiseaux modèles comme le poulet.
“By using conservation genomics, future reintroduction programmes can avoid releasing individuals with high genetic load.Cela aiderait à réduire la consanguinité et à améliorer la récupération à long terme d'espèces menacées telles que le pigeon rose.”
‘Genomic erosion in a demographically recovered bird species during conservation rescue’ is published inConserveationBiology on May 13.
Reference: Jackson HA, Percival-Alwyn L, Ryan C, et al.Érosion génomique dans une espèce d'oiseau rétrogramique récupérée pendant le sauvetage de conservation.Conserve.Biol.2022; 0 (0): E13918.doi: 10.1111 / Cobi.13918
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